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Microbiología
Nuevo Método Para Identificar
Microbios
31 de
Marzo de 2006.
 Un
grupo de científicos ha desarrollado una nueva técnica de alta
eficiencia para identificar la gran variedad de especies de
microorganismos que habitan en una determinada "comunidad microbiana".
El método ofrece muchas aplicaciones, desde estimar la cantidad de
microbios presentes en muestras tomadas del medio ambiente e identificar
especies útiles para tratar la contaminación, hasta identificar
patógenos y distinguir bacterias inofensivas de las potencialmente
usadas en un ataque bioterrorista.
El trabajo se ha realizado en el Laboratorio Nacional Brookhaven. "Las
comunidades microbianas se caracterizan por su gran diversidad y
complejidad, con cientos de especies por mililitro de agua, o miles por
gramo de suelo", resalta el biólogo Daniel (Niels) van der Lelie, autor
principal del estudio. "Clarificar esta complejidad es esencial si
queremos entender totalmente los roles que los microbios tienen en los
ciclos globales, aprovechar sus enormes capacidades metabólicas, o
identificar fácilmente amenazas potenciales para la salud humana".
Cultivar poblaciones de microbios para identificar especies es lento y
propenso a errores puesto que las condiciones del cultivo con frecuencia
ocultan a importantes miembros de la comunidad. Secuenciar genomas
completos, si bien es muy específico e informativo, sería una tarea
demasiado intensiva y costosa. Así pues, los científicos han estado
explorando caminos para identificar segmentos claves del código genético
que sean lo bastante cortos para ser secuenciados con rapidez y que
permitan distinguir con facilidad entre las especies.
El equipo del laboratorio Brookhaven ha desarrollado una técnica en la
cual, utilizando enzimas que reconocen secuencias específicas en el
código genético, los investigadores cortan los genomas microbianos en
pequeños segmentos que contienen genes identificadores comunes a todas
las especies microbianas, además de suficiente información genética para
distinguir entre los diferentes microbios.
Para secuencias que no concuerden con uno de los genomas bacterianos ya
secuenciados (de los cuales sólo se dispone de unos doscientos), los
científicos pueden secuenciar el gen ribosomal completo adjunto a partir
de esa primera "etiqueta". Si aún así no encaja con ninguno, entonces la
etiqueta probablemente identifique a una nueva especie.
En otra prueba con posibles aplicaciones para identificar agentes
utilizados en ataques bioterroristas, la técnica también discrimina
claramente entre cepas muy relacionadas de Bacillus cereus, un microbio
patógeno del suelo, y el Bacillus anthracis, la causa bacteriana del
ántrax (carbunclo).
Esta técnica podría ayudar también a valorar cómo la composición de una
comunidad microbiana responde a los cambios medioambientales. Tal
información podría ayudar a identificar qué combinaciones de especies
serían más apropiadas para, por ejemplo, retirar carbono o limpiar la
contaminación radiológica.
Información adicional en:
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